pygbif

An interface to the GBIF API for the Python programming language.

pygbif is a Python package that allows searching and retrieving data from GBIF. pygbif wraps Python code around the GBIF API to allow you to talk to GBIF from Python and access metadata, species names, and occurrences.

La documentación principal de pygbif se puede encontrar en https://pygbif.readthedocs.io/.

Instalación

Instalando la versión estable de PyPI

pip install pygbif

Instalando la versión de desarrollo

pip install git+git://github.com/gbif/pygbif.git#egg=pygbif

Primeros pasos

(Based on the example from the documentation.)

First, load the library:

from pygbif import species as species
from pygbif import occurrences as occ

Busque las claves taxonómicas de la base taxonómica de GBIF a partir de una lista de nombres:

splist = ['Cyanocitta stelleri', 'Junco hyemalis', 'Aix sponsa',
  'Ursus americanus', 'Pinus conorta', 'Poa annuus']
keys = [ species.name_backbone(x)['usageKey'] for x in splist ]

Then, get a count of occurrence records for each taxon, and pull out number of records found for each taxon:

out = [ occ.search(taxonKey = x, limit=0)['count'] for x in keys ]

Cree un diccionario de nombres de especies y número de registros, ordenando en orden descendente:

x = dict(zip(splist, out))
sorted(x.items(), key=lambda z:z[1], reverse=True)

Citación

Bajo los términos del acuerdo de usuario de datos de GBIF, los usuarios que descargan datos acuerdan citar un DOI. Por favor, consulte la guía para citar de GBIF https://www.gbif.org/es/citation-guidelines.

Por favor, cite también pygbif.